Al meerdere keren hebben e-sigaretten in ingecheckte bagage door onbedoelde inschakeling brand veroorzaakt. Voor passagiers is het daarom alleen nog toegestaan e-sigaretten mee te nemen in de handbagage.
De in Canada gevestigde Internationale Burgerluchtvaartorganisatie (International Civil Aviation Organization, ICAO) heeft het meenemen van apparaten in ingecheckte bagage verboden vanwege brandgevaar. Het opladen van e-sigaretten in de cabine is ook niet toegestaan. De reden hiervoor is dat de verwarmingselementen van de kleine apparaten zich onbedoeld kunnen inschakelen en hierdoor brand in de bagage kunnen veroorzaken. In tegenstelling tot de bagageruimte kan in de cabine eenvoudiger worden ingegrepen in een dergelijk geval.
Ook als uw e-sigaretten in de handbagage binnen handbereik zijn, is het gebruik hiervan aan boord verboden bij de meeste luchtvaartmaatschappijen, net als met normale sigaretten.